In "Dragon Ball Z Movie 11: Bio-Broly" wird die Handlung um den legendären Saiyajin-Krieger Broly fortgesetzt, der in diesem Film jedoch in einer neuen Form wiederbelebt wird. Der Film beginnt mit der Einführung von Mr. Satan, der von einem reichen Unternehmer namens Dr. Kochin eingeladen wird, um an einem Kampfturnier teilzunehmen. Mr. Satan nimmt die Einladung an und reist mit seiner Tochter Videl sowie Goten und Trunks zu einer abgelegenen Insel. Dort angekommen, stellt sich heraus, dass das Turnier eine Falle ist. Dr. Kochin und seine Assistentin Dr. Lychee planen, die DNA von Broly zu nutzen, um einen neuen Bio-Krieger zu erschaffen.

Die Wissenschaftler haben Brolys Zellen gesammelt und experimentieren damit, um einen noch stärkeren und unkontrollierbaren Klon zu erschaffen. Durch einen Unfall im Labor wird der Bio-Broly freigesetzt, der sich als äußerst zerstörerisch und schwer zu besiegen erweist. Goten und Trunks versuchen, den Bio-Broly aufzuhalten, doch selbst ihre kombinierten Kräfte reichen nicht aus, um ihn zu besiegen. Der Bio-Broly entwickelt sich weiter und wird immer mächtiger, während er die Insel verwüstet.

Im Laufe des Films wird deutlich, dass der Bio-Broly nicht nur eine physische Bedrohung darstellt, sondern auch eine emotionale Herausforderung für die Charaktere, da sie mit der Erinnerung an den ursprünglichen Broly konfrontiert werden. Goten und Trunks erhalten schließlich Unterstützung von Krillin und Android 18, die ebenfalls auf der Insel eintreffen. Gemeinsam versuchen sie, den Bio-Broly zu besiegen, doch seine Regenerationsfähigkeiten und seine immense Stärke machen ihn zu einem fast unbesiegbaren Gegner.

Die Handlung gipfelt in einem epischen Kampf, bei dem Goten und Trunks ihre Super-Saiyajin-Formen nutzen, um gegen den Bio-Broly anzutreten. Trotz ihrer Bemühungen scheint der Kampf aussichtslos, bis schließlich die Umgebung selbst – ein See aus Säure – zur entscheidenden Waffe wird. Der Bio-Broly wird in den Säuresee gezogen, wo er langsam aufgelöst wird und schließlich besiegt ist. Der Film endet mit der Rückkehr der Charaktere in ihre Heimat, während die Insel aufgrund der Zerstörungen unbewohnbar bleibt.