Sanetsuna Kuroda zählt zu Shinogaras sechs Elite-Ninja-Agenten. Er verfolgt unerbittlich den Protagonisten Hayate, nachdem dieser seinen eigenen Vater, den Anführer Shinogaras, ermordet hat. Während dieser Jagd fügt Sanetsuna Hayate lebensbedrohliche Verletzungen zu, was Hayate direkt dazu zwingt, seine Seele zur Rettung in den Körper seiner Schwester Shiori zu transferieren. Sanetsuna behält eine unerschütterliche antagonistische Rolle bei, entschlossen, Hayate dafür zu fassen, dass er Shinogaras geheime Vorherrschaft über Japan verraten hat.