生き物が大好きだが人間、特に霊長類と話すのが苦手な女子高生・苔石花江は、高校生活で「友達を3人作る」という目標を掲げて東京都の大神高校に入学する。彼女の双子の妹・苔石咲月は中学校で全国大会に出場したバスケットボールのエースであり、推薦で関西の強豪校へ進んだため、花江は妹の影から離れて新たなスタートを切ろうとしていた。

入学早々、クラスメートで初めての友達となった小緑つぼみが、同じ一年生の栗原夏凛からバスケ部への入部を初心者であることを理由に拒否される場面に立ち会う。花江は思わず夏凛に一対一の勝負を挑み、妹との厳しい練習で培った驚異的なディフェンス力で夏凛を完封する。そのプレーを見た二年生の藤咲音ら先輩たちの勧誘と、つぼみの熱意に心を動かされ、花江はバスケ部への入部を決意する。

大神高校女子バスケ部は前年度のインターハイ東京都予選で強豪・爽栄女学院に敗れ、その後一年間公式戦に出場していない弱小チームだ。花江は小柄ながらも観察力と反射神経を活かし、独自の「バスケ論」――生物の生態や共生関係を比喩に用いた戦術思考――でチームに新風を吹き込む。初の練習試合である爽栄女学院戦では惜敗するものの、花江のディフェンスが光り、チームに確かな手応えをもたらす。

物語はインターハイ予選へと突入し、特に護円高校との初戦が大きな山場となる。護円はアメリカから来た大型エース・アリーを擁し鉄壁のゾーンディフェンスを誇る。花江は自らのディフェンスでチームを支え、つぼみや夏凛、藤先輩らとの連携を深めながら拮抗した試合を展開。最終的に大神高校が劇的な勝利を収め、花江はチームスポーツの中で初めて「独りではない」という実感を得る。

主要キャラクターとして、無邪気で純粋なバスケ初心者の小緑つぼみ、プライドが高いが徐々に花江を認める栗原夏凛、冷静沈着でチームをまとめる藤咲音、そして花江の憧れであり越えるべき壁でもある双子の妹・苔石咲月がいる。花江はバスケを通じて自己肯定感を高め、コミュニケーションの壁を少しずつ乗り越えていく。姉妹の関係や過去の因縁も今後の展開の鍵となっている。

全編を通じ、花江の内面的な成長とチームの結束が丁寧に描かれる青春スポーツグラフィティである。