"Die Marginal Service" ist eine Anime-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Gesellschaft von einer strengen Klassentrennung geprägt ist. Die Handlung konzentriert sich auf eine Gruppe von Individuen, die als "Marginals" bezeichnet werden – Menschen, die aufgrund ihrer Herkunft, Fähigkeiten oder sozialen Stellung an den Rand der Gesellschaft gedrängt wurden. Diese Gruppe schließt sich zusammen, um gegen das unterdrückerische System zu kämpfen, das von einer mächtigen Regierung und korrupten Konzernen kontrolliert wird.

Die Hauptfigur, Kaito, ist ein junger Mann, der aufgrund seiner außergewöhnlichen Fähigkeiten, sogenannter "Marginal Skills", verfolgt wird. Diese Fähigkeiten, die oft als Bedrohung für die bestehende Ordnung angesehen werden, machen ihn zu einem Ziel der Regierung. Kaito trifft auf eine Gruppe von Gleichgesinnten, darunter die charismatische Anführerin Rena, den technisch begabten Hiro, und die mysteriöse Sniperin Yuki. Zusammen bilden sie eine Widerstandsgruppe, die als "Marginal Service" bekannt wird.

Die Serie folgt ihren Bemühungen, die Unterdrückung zu bekämpfen und die Wahrheit über die Marginal Skills und die Regierung zu enthüllen. Dabei müssen sie sich nicht nur mit den staatlichen Sicherheitskräften auseinandersetzen, sondern auch mit inneren Konflikten und moralischen Dilemmata. Die Handlung ist geprägt von politischen Intrigen, Action-Szenen und der Entwicklung der Charaktere, die sich mit Themen wie Identität, Loyalität und Gerechtigkeit auseinandersetzen.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass die Marginal Skills nicht nur eine Bedrohung darstellen, sondern auch das Potenzial haben, die Gesellschaft zu verändern. Die Charaktere müssen entscheiden, wie sie ihre Fähigkeiten einsetzen wollen – ob für persönliche Rache, für die Befreiung anderer Marginals oder für einen größeren gesellschaftlichen Wandel. Die Serie endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen und mögliche Fortsetzungen lässt.